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Table 4 Distribution of QTLs in the RIL experiments

From: Meta-analysis of cotton fiber quality QTLs across diverse environments in a Gossypium hirsutum x G. barbadenseRIL population

  

Fineness

Length

Uniformity

Strength

Elongation

Color

Total

Site

Br7

9 (39)

2 (8)

1 (5)

0 (3)

3 (11)

5 (14)

20 (80)

 

Br8

6 (21)

0 (4)

1 (7)

0 (4)

3 (7)

4 (12)

14 (55)

 

Cs7

5 (21)

0 (2)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

5 (23)

 

Cs8

3 (23)

3 (16)

3 (11)

0 (5)

2 (9)

0 (0)

11 (64)

 

Cs9

9 (20)

1 (4)

3 (7)

0 (3)

0 (4)

0 (0)

13 (38)

 

Ga7

7 (32)

4 (12)

3 (7)

0 (5)

1 (2)

4 (16)

19 (74)

 

Ge6

4 (14)

3 (14)

0 (0)

3 (5)

0 (0)

8 (17)

18 (50)

 

Lu7

9 (40)

6 (26)

0 (0)

3 (14)

0 (0)

4 (9)

22 (89)

 

Lu8

5 (21)

1 (8)

1 (6)

1 (8)

3 (4)

0 (0)

11 (47)

 

Mp7

3 (12)

2 (9)

0 (0)

3 (8)

0 (0)

3 (18)

11 (47)

 

Mp8

6 (27)

5 (13)

2 (6)

2 (5)

4 (12)

4 (21)

23 (84)

Chromosome

1

1 (1)

1 (2)

0 (0)

0 (2)

0 (1)

2 (5)

4 (11)

 

2

1 (13)

0 (5)

0 (1)

0 (0)

3 (6)

0 (0)

4 (25)

 

3

1 (5)

5 (12)

0 (1)

0 (5)

0 (1)

0 (0)

6 (24)

 

4

3 (7)

5 (9)

0 (0)

1 (5)

0 (0)

0 (1)

9 (22)

 

5

3 (8)

0 (10)

1 (6)

0 (1)

0 (0)

1 (3)

5 (28)

 

6

2 (7)

1 (1)

0 (3)

0 (3)

1 (2)

5 (11)

9 (27)

 

7

0 (5)

0 (0)

0 (0)

1 (4)

0 (0)

2 (6)

3 (15)

 

8

0 (2)

0 (6)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

8 (25)

8 (33)

 

9

3 (24)

2 (8)

1 (4)

1 (5)

1 (4)

2 (6)

10 (51)

 

10

1 (7)

0 (2)

0 (1)

0 (1)

0 (0)

0 (3)

1 (14)

 

11

0 (5)

0 (4)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

2 (6)

2 (15)

 

12

6 (20)

0 (2)

7 (14)

2 (6)

2 (4)

0 (3)

17 (49)

 

13

0 (5)

1 (3)

0 (0)

0 (1)

1 (2)

0 (0)

2 (11)

 

14

0 (6)

1 (8)

0 (0)

1 (2)

0 (0)

1 (3)

3 (19)

 

15

9 (27)

0 (0)

1 (4)

1 (1)

3 (10)

2 (5)

16 (47)

 

16

4 (10)

0 (0)

1 (4)

0 (1)

0 (0)

0 (1)

5 (16)

 

17

5 (14)

0 (1)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (1)

5 (16)

 

18

3 (14)

0 (1)

0 (0)

0 (2)

0 (1)

1 (1)

4 (19)

 

19

3 (10)

2 (7)

1 (3)

2 (7)

2 (7)

0 (3)

10 (37)

 

20

2 (8)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (1)

0 (1)

2 (10)

 

21

5 (20)

2 (9)

0 (1)

2 (8)

2 (2)

2 (8)

13 (48)

 

22

1 (8)

0 (0)

0 (0)

0 (0)

0 (3)

1 (1)

2 (12)

 

23

1 (4)

0 (4)

1 (2)

0 (0)

0 (0)

0 (2)

2 (12)

 

24

2 (8)

2 (7)

0 (0)

0 (1)

0 (3)

0 (0)

4 (19)

 

25

7 (22)

0 (5)

0 (2)

0 (3)

0 (0)

3 (12)

10 (44)

 

26

3 (10)

5 (10)

1 (3)

1 (2)

1 (2)

0 (0)

11 (27)

 

Total

66 (270)

27 (116)

14 (49)

12 (60)

16 (49)

32 (107)

167 (651)

  1. Distribution of the 167 significant QTLs (LOD > permutation based threshold) and of the total 651 QTLs (including putative QTLs of LOD > 2 shown in parentheses) from the analysis of the RIL phenotypic data and shared among the 6 fiber trait categories, 11 sites and 26 chromosomes.
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BMC Plant Biology

ISSN: 1471-2229

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