Repository of samples/Collection number | CRA-OLI/92 | CRA-OLI1/32 | WOGB2/12, 691 | WOGB/128 | WOGB/5, 787 | WOGB/114 |
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Polymorphic sites | Chloroptype 1 (Frantoio) | Chloroptype 2 (Canino) | Chloroptype 3 (Farga, Kalogerida) | Chloroptype 4 (Galega) | Chloroptype 5 (Lechin Sevilla, Sorani) | Chloroptype 6 (Oueslati) |
P1 | G | A | A | G | A | A |
P2 | T | A | T | T | T | A |
P3 | T | C | T | T | C | C |
P4 | T12 | T11 | T10 | T12 | T11 | T11 |
P5 | T11 | T12 | T12 | T11 | T12 | T12 |
P6 | T12 | T11 | T12 | T12 | T11 | T11 |
P7 | A | A | C | A | A | A |
P8 | T11 | T10 | T11 | T11 | T10 | T10 |
P9 | T | C | C | T | C | C |
P10 | A | / | A | A | T | / |
P11 | TTAGATA | - | TTAGATA | TTAGATA | - | - |
P12 | - | A4(G)A5 | A4(G)A5 | - | A4(G)A5 | A4(G)A5 |
P13 | A12 | A14 | A11 | A12 | A14 | A14 |
P14 | T | G | T | T | G | G |
P15 | A15 | A16 | A16 | A15 | A16 | A16 |
P16 | C10 | C11 | C11 | C11 | C10 | C10 |
P17 | T11 | T10 | T10 | T11 | T10 | T10 |
P18 | A12 | A12 | A13 | A12 | A12 | A12 |
P19 | C | T | C | C | T | T |
P20 | A13 | A13 | A12 | A13 | A13 | A13 |
P21 | C | C | T | C | T | C |
P22 | A10 | A10 | A11 | A10 | A10 | A10 |
P23 | C | C | T | C | C | C |
P24 | A | A | G | A | A | A |
P25 | A12 | A12 | A11 | A12 | A12 | A12 |
P26 | C | C | C | C | T | C |
P27 | A | G | G | A | G | G |
P28 | A6 | A7 | A6 | A6 | A7 | A7 |
P29 | C | T | C | C | C | T |
P30 | T | G | G | G | G | G |
P31 | T18 | T11 | T18 | T17 | T11 | T11 |
P32 | TTAATC TAGTTC | TTAATCTAGTTC | - | TTAATC TAGTTC | TTAATCTAGTTC | TTAATC TAGTTC |
P33 | T | G | G | G | T | T |
P34 | T | A | T | T | A | A |
P35 | A | G | G | A | G | G |
P36 | T10 | T9 | T9 | T10 | T9 | T9 |
P37 | A14 | A7(T)A5 | A7(T)A5 | A14 | A7(T)A5 | A7(T)A5 |
P38 | C | A | A | C | A | A |
P39 | A | A | C | A | A | A |
P40 | G | G | T | G | G | G |