|  | Functional DNA (PCR) markers** | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Season | Carotenoids* | crtRB15′TE | crtRB1Indel4 | crtRB13′TE | lcyE5TE | lcyE216(SNP) | lcyE3′Indel | ||||||
 |  | P | R2 | P | R2 | P | R2 | P | R2 | P | R2 | P | R2 |
Year 1 | βcar | 6.6E-13 | 0.53 |  |  | 1.2E-12 | 0.51 |  |  |  |  |  |  |
 | βcry | 2.8E-08 | 0.32 |  |  | 1.5E-07 | 0.28 |  |  |  |  |  |  |
 | zeax | 3.7E-08 | 0.31 |  |  | 1.5E-07 | 0.28 |  |  |  |  |  |  |
 | lut |  |  |  |  |  |  | 3.1E-03 | 0.11 | 1.6E-03 | 0.08 |  |  |
 | pva | 1.2E-07 | 0.26 | 2.3E-03 | 0.09 | 6.5E-07 | 0.23 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/βcry | 8.6E-12 | 0.47 |  |  | 7.7E-11 | 0.42 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/Zeax | 4.1E-11 | 0.45 |  |  | 1.7E-10 | 0.42 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/all | 5.4E-08 | 0.30 |  |  | 3.7E-08 | 0.30 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβbr/αbr | 1.3E-04 | 0.15 |  |  | 4.7E-04 | 0.13 |  |  | 6.7E-04 | 0.10 |  |  |
Year 2 | βcar | 4.4E-10 | 0.38 |  |  | 7.9E-11 | 0.42 |  |  |  |  |  |  |
 | βcry | 4.6E-08 | 0.30 |  |  | 7.7E-08 | 0.29 |  |  |  |  |  |  |
 | zeax | 1.2E-05 | 0.20 |  |  | 9.5E-06 | 0.20 |  |  |  |  |  |  |
 | lut |  |  |  |  |  |  | 1.2E-04 | 0.18 | 2.7E-05 | 0.15 | 6.9E-04 | 0.12 |
 | tpva | 2.2E-05 | 0.17 |  |  | 4.8E-06 | 0.20 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/βcry | 2.1E-14 | 0.63 |  |  | 1.3E-13 | 0.58 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/Zeax | 8.1E-11 | 0.44 |  |  | 1.3E-11 | 0.47 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/all | 5.4E-09 | 0.34 |  |  | 2.5E-10 | 0.41 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβbr/αbr |  |  |  |  |  |  | 2.6E-04 | 0.16 | 9.1E-07 | 0.21 | 5.8E-05 | 0.17 |
Combined*** | βcar | 3.4E-12 | 0.49 |  |  | 2.5E-12 | 0.50 |  |  |  |  |  |  |
 | βcry | 1.1E-08 | 0.34 |  |  | 3.2E-08 | 0.31 |  |  |  |  |  |  |
 | zeax | 1.6E-06 | 0.24 |  |  | 1.8E-06 | 0.23 |  |  |  |  |  |  |
 | lut |  |  |  |  |  |  | 4.3E-05 | 0.20 | 1.5E-06 | 0.20 |  |  |
 | tpva | 1.2E-08 | 0.31 |  |  | 6.3E-09 | 0.33 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/βcry | 1.8E-14 | 0.63 |  |  | 8.4E-14 | 0.59 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/Zeax | 1.9E-11 | 0.47 |  |  | 1.1E-11 | 0.48 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβcar/all | 9.3E-09 | 0.33 |  |  | 4.5E-10 | 0.39 |  |  |  |  |  |  |
 | lnβbr/αbr | 8.1E-03 | 0.08 |  |  |  |  | 7.2E-04 | 0.14 | 2.0E-06 | 0.20 | 8.3E-03 | 0.08 |