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Table 3 Screening amiRNA-expressed transgenic potato lines

From: Reduced polyphenol oxidase gene expression and enzymatic browning in potato (Solanum tuberosum L.) with artificial microRNAs

Transgenic line

Kan

Insert

Relative expression level of target gene

amiRNA

POTP1/P2

POT32

POT33

POT72

amiRPPO1-2

+

+

0.02 ± 0

   

+

amiRPPO1-3

+

+

0.06 ± 0

   

+

amiRPPO1-7

+

+

0.14 ± 0

   

+

amiRPPO1-8

+

+

0.03 ± 0

   

n.t.

amiRPPO1-9

+

+

0.15 ± 0.01

   

n.t.

amiRPPO1-10

+

n.t.

n.t.

   

n.t.

amiRPPO1-12

+

+

0.34 ± 0

   

+

amiRPPO1-13

+

n.t.

n.t.

   

n.t.

WT

-

-

0.99 ± 0.08

   

-

amiRPPO2-1

+

n.t.

 

n.t.

  

-

amiRPPO2-4

+

n.t.

 

1.42 ± 0.12

  

-

amiRPPO2-9

+

+

 

n.t.

  

-

amiRPPO2-12

+

+

 

1.03 ± 0.02

  

-

amiRPPO2-13

+

n.t.

 

n.t.

  

-

amiRPPO2-15

+

n.t.

 

0.83 ± 0.11

  

-

amiRPPO2-16

+

+

 

0.45 ± 0.03

  

-

amiRPPO2-17

+

n.t.

 

n.t.

  

-

amiRPPO2-18

+

+

 

1.07 ± 0.04

  

-

amiRPPO2-19

+

+

 

0.99 ± 0.03

  

-

WT

-

-

 

1.00 ± 0.01

  

-

amiRPPO3-8

+

+

  

1.29 ± 0.23

 

+

amiRPPO3-9

+

n.t.

  

n.t.

 

n.t.

amiRPPO3-12

+

+

  

0.66 ± 0.12

 

+

amiRPPO3-13

+

n.t.

  

0.97 ± 0.17

 

n.t.

amiRPPO3-14

+

+

  

n.t.

 

n.t.

amiRPPO3-15

+

+

  

n.v.

 

+

amiRPPO3-16

+

n.t.

  

1.31 ± 0.40

 

n.t.

amiRPPO3-17

+

+

  

n.t.

 

n.t.

amiRPPO3-18

+

+

  

n.t.

 

n.t.

WT

-

-

  

1.00 ± 0

 

-

amiRPPO23-3

+

+

 

n.t.

n.t.

 

n.t.

amiRPPO23-4

+

n.t.

 

1.03 ± 0.11

1.28 ± 0.29

 

n.t.

amiRPPO23-5

+

+

 

0.32 ± 0.01

0.44 ± 0.08

 

+

amiRPPO23-7

+

+

 

0.28 ± 0.03

0.19 ± 0.01

 

+

amiRPPO23-8

+

+

 

0.42 ± 0

0.01 ± 0

 

+

amiRPPO23-9

+

+

 

0.07 ± 0.01

0.01 ± 0

 

+

amiRPPO23-14

+

n.t.

 

n.t.

n.t.

 

n.t.

amiRPPO23-15

+

n.t.

 

0.23 ± 0.07

0.00 ± 0

 

n.t.

amiRPPO23-16

+

n.t.

 

n.t.

n.t.

 

n.t.

WT

-

-

 

1.00 ± 0.08

1.00 ± 0.12

 

-

amiRPPO234-3

+

n.t.

 

n.t.

n.t.

n.t.

-

amiRPPO234-4

+

n.t.

 

n.t.

n.t.

n.t.

-

amiRPPO234-5

+

+

 

0.87 ± 0.06

0.92 ± 0.14

1.03 ± 0.17

-

amiRPPO234-6

+

n.t.

 

0.98 ± 0.12

3.39 ± 0.47

1.50 ± 0.08

-

amiRPPO234-7

+

+

 

1.22 ± 0.16

1.16 ± 0.09

1.04 ± 0.17

-

amiRPPO234-8

+

+

 

1.66 ± 0.02

0.71 ± 0.04

0.69 ± 0.02

-

amiRPPO234-9

+

+

 

0.47 ± 0.04

0.40 ± 0.09

0.50 ± 0.13

-

amiRPPO234-10

+

+

 

0.61 ± 0.03

0.61 ± 0.09

0.54 ± 0.21

-

amiRPPO234-11

+

n.t.

 

1.35 ± 0.16

0.83 ± 0.17

1.16 ± 0.13

-

amiRPPO234-13

+

n.t.

 

n.t.

n.t.

n.t.

-

WT

-

-

 

1.00 ± 0.01

1.00 ± 0.08

1.00 ± 0.01

-

amiRPPO234A-2

+

n.t.

 

1.09 ± 0.20

1.53 ± 0.19

1.26 ± 0.13

n.t.

amiRPPO234A-4

+

+

 

0.34 ± 0.05

0.43 ± 0.07

0.04 ± 0.01

+

amiRPPO234A-6

+

+

 

0.09 ± 0.01

0.02 ± 0

0.05 ± 0.01

+

amiRPPO234A-10

+

+

 

1.07 ± 0.03

0.77 ± 0.25

0.47 ± 0.02

+

amiRPPO234A-13

+

+

 

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

amiRPPO234A-14

+

+

 

0.58 ± 0

0.22 ± 0.01

0.15 ± 0.03

+

amiRPPO234A-15

+

n.t.

 

1.25 ± 0.18

0.8 ± 0.12

1.34 ± 0.16

n.t.

amiRPPO234A-16

+

n.t.

 

0.83 ± 0.12

1.21 ± 0.09

0.60 ± 0.07

n.t.

WT

-

-

 

0.99 ± 0.08

1.01 ± 0.18

0.99 ± 0.05

-

amiRPPO1234-1

+

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

amiRPPO1234-2

+

+

0.52 ± 0.07

0.30 ± 0.03

0.46 ± 0.01

0.34 ± 0.08

+

amiRPPO1234-3

+

+

0.43 ± 0.04

0.19 ± 0.06

0.07 ± 0

0.43 ± 0.1

n.t.

amiRPPO1234-6

+

+

0.27 ± 0.03

0.20 ± 0.04

0.19 ± 0

0.2 ± 0.04

+

amiRPPO1234-7

+

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

amiRPPO1234-8

+

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

amiRPPO1234-9

+

+

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

n.t.

amiRPPO1234-11

+

n.t.

0.15 ± 0.01

0.34 ± 0.11

1.85 ± 0.17

0.08 ± 0.01

n.t.

amiRPPO1234-12

+

+

0.28 ± 0.03

0.66 ± 0.02

0.47 ± 0.03

0.18 ± 0.01

+

amiRPPO1234-16

+

n.t.

0.42 ± 0.03

0.14 ± 0.03

0.15 ± 0

0.08 ± 0.06

n.t.

WT

-

-

1.00 ± 0.09

1.00 ± 0.1

1.00 ± 0.19

1.00 ± 0.07

-

  1. Note: Kan, is selection of transgenic lines with Kanamycin (100 mg/L); +, Kanamycin resistant; −, Kanamycin susceptible (such as for WT). Insert, is transgene insertion into the chromosome(s) detected by PCR; +, positive in PCR detection; −, negative in PCR detection; n.t., not test. Relative expression level of target gene, was assayed using in vitro cultured potato leaf and stem tissues by qRT-PCR; the data is the average of three technical repeats and their standard deviation of using one original sample from each transgenic line; n.v., no value; n.t. not test. amiRNA, is detection of mature amiRNAs by RT-PCR; +, detectable (positive); −, not detectable (negative); n.t., not test.