Skip to main content

Table 2 Phenotyping of the Versailles core collection.

From: Natural variation in CBF gene sequence, gene expression and freezing tolerance in the Versailles core collection of Arabidopsis thaliana

Name

Origin

Mean at day 5

Rank at day 5

Mean at day 8

Rank at day 8

LT50

70 AV

Kn-0

Lituania

0.0

1

0.7

1

 

215 AV

Mh-1

Poland

1.0

4

1.0

2

 

229 AV

Rld-2

Russia

1.0

4

1.0

2

-9.1

231 AV

Rub-1

Ukraine

1.3

5

1.0

2

-10.7

244 AV

WS

 

1.0

4

1.0

2

-10.6

236 AV

Shakdara

Tadjikistan

0.7

2

1.3

3

 

92 AV

Stw-0

Russia

1.3

6

1.7

4

 

91 AV

Tsu-0

Japan

0.8

3

1.9

5

 

93 AV

Ms-0

Russia

2.2

11

2.0

6

 

40 AV

Pi-0

Austria

2.3

12

2.0

6

 

162 AV

Ct-1

Italy

1.6

8

2.1

7

 

160 AV

Ri-0

Canada

2.3

13

2.6

8

 

94 AV

Mt-0

Libya

2.5

15

2.7

9

 

235 AV

Sav-0

Czech Rep.

2.7

16

2.7

9

 

63 AV

Lip-0

Poland

1.8

9

2.7

9

 

224 AV

Oy-0

Norway

2.3

12

3.0

10

 

53 AV

Sp-0

Germany

2.7

16

3.0

10

 

206 AV

Jm-0

Czech Rep.

2.5

14

3.3

11

 

172 AV

Bur-0

Eire

3.2

18

3.3

12

 

197 AV

Enkheim-T

Germany

3.6

19

3.3

12

 

266 AV

N13

Russia

2.3

13

3.5

13

 

263 AV

N7

Russia

4.5

27

3.7

14

 

42 AV

Bl-1

Italy

2.7

16

3.9

15

 

252 AV

Akita

Japan

3.6

20

4.2

17

 

186 AV

Col-0

 

4.3

26

4.5

18

-9.7

200 AV

Gre-0

USA

5.0

32

4.6

19

 

56 AV

Ta-0

Czech Rep.

2.7

16

4.7

20

 

250 AV

Yo-0

USA

3.8

21

4.7

20

 

178 AV

Alc-0

Spain

4.0

23

4.8

21

 

180 AV

Blh-1

Czech Rep.

4.5

27

5.0

22

 

8 AV

Dijon-8

France

4.5

27

5.0

22

 

234 AV

Sap-0

Czech Rep.

4.6

29

5.0

22

 

257 AV

Sakata

Japan

4.5

28

5.3

23

 

262 AV

N6

Russia

4.8

30

5.3

23

 

50 AV

Pa-1

Italy

4.3

25

5.3

23

 

190 AV

Condara

Tadjikistan

4.9

31

5.7

24

 

95 AV

Nok-1

Netherlands

4.0

22

5.7

24

 

157 AV

Ita-0

Morocco

5.8

34

5.8

25

-6.0

267 AV

N14

Russia

5.3

33

5.9

26

 

166 AV

Cvi-0

Cape Verde Island

6.0

35

6.0

27

-7.5

25 AV

Dijon-25

France

5.8

34

6.0

27

 

101 AV

Ge-0

Switzerland

4.0

23

6.0

27

 

163 AV

Can-0

Canary Islands

6.0

35

6.0

27

-5.8

62 AV

St-0

Sweden

4.0

23

6.0

27

 

83 AV

Edi-0

United Kingdom

4.5

28

6.0

27

 

233 AV

Sah-0

Spain

6.0

35

6.0

27

-5.4

253 AV

Ishikawa

Japan

6.0

35

6.0

27

 

76 AV

Bla-1

Spain

5.8

34

6.0

27

 

68 AV

Te-0

Finland

4.1

24

6.0

27

 

21 AV

Dijon-21

France

6.0

35

6.0

27

 
  1. Accessions were grown as described in the methods, acclimated for 7 days at 5°C, and then exposed to -5°C for 48 hours. Notes were given as described after 5 days and 8 days of recovery. Accessions are sorted from freezing tolerant to freezing sensitive at day 8 (top to bottom). The accessions Col-0 and WS, which are not in the core collection, were also included. Freezing tolerant cold core accessions are in bold and freezing sensitive in italics For LT50 measurements, see Methods.