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Table 2 Effect of infection of different Agrobacterium strains, E. coli, and their heat-killed forms on somatic mutation rates

From: Suppression of different classes of somatic mutations in Arabidopsis by vir gene-expressing Agrobacterium strains

Strain name

Time interval (hours)

Nature of mutation

Transversion

C → T Transition

SHR

FSM

Transposition

T → G

T → A

Agrobacterium

VOT

0.5

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

â–«

â–«

1

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

â–«

â–«

3

↑↑

↑↑

â–ª

↑↑

â–«

â–«

6

↑

↑

â–ª

â–ª

â–«

â–«

9

↑

â–ª

â–ª

↓↓

â–«

â–«

12

↑

â–ª

â–ª

↓↓

â–«

â–«

24

↓↓

↓

â–ª

↓↓

â–«

â–«

48

↓↓

↓

â–ª

↓↓

↓↓

↑↑

XXX

0.5

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

â–«

â–«

1

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

â–«

â–«

3

↑↑

↑

â–ª

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â–«

6

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â–«

â–«

9

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12

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24

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48

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

↑↑

VXX

48

↓

↓↓

â–ª

↓↓

↓↓

↑↑

VXT

48

↓↓

↓↓

â–ª

↓↓

↓↓

↑↑

Heat-killed VOT

48

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

↑↑

E. coli

0.5

â–ª

â–«

â–ª

â–ª

â–«

â–«

1

â–ª

â–«

â–ª

â–ª

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â–«

3

↑↑

â–«

â–ª

â–ª

â–«

â–«

6

↑↑

â–«

â–ª

â–ª

â–«

â–«

9

↑↑

â–«

â–ª

â–ª

â–«

â–«

12

↑↑

â–«

â–ª

â–ª

â–«

â–«

24

↑↑

â–«

â–ª

â–ª

â–«

â–«

48

↑↑

↑↑

â–ª

â–ª

â–ª

↑↑

Heat killed E. coli

48

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

â–ª

↑↑

  1. SHR, somatic homologous recombination; FSM, frame-shift mutation; ▪, no change (P > 0.05) compared to uninfected control; ↑↑, significant increase (P < 0.05) compared to uninfected control; ↓↓, significant decrease (P < 0.05) compared to uninfected control; ↑, increase, but not significant (P > 0.05) compared to uninfected control; ↓, decrease, but not significant (P > 0.05) compared to uninfected control; ▫, not analysed