Genome-wide analysis of the plant-specific PLATZ proteins in maize and identification of their general role in interaction with RNA polymerase III complex

Table 2 Identification protein domains of 17 PLATZs by Pfam and SMART databases

Family members	Model V4	CDS Length	Signal Peptide	PLATZ Domain	BBOX Domain	Coiled-Coil	Low Comlexity Region
ZmPLATZ1	Zm00001d028594	231		170–199	129–169		36–53
ZmPLATZ2	Zm00001d029437	309		155–229	111–154	68–89	269–291
ZmPLATZ3	Zm00001d030032	254		109–185			21–34,79-97,205–216
ZmPLATZ4	Zm00001d031925	212	1–31	74–152			160–178
ZmPLATZ5	Zm00001d002489	256		87–158	46–86		14–27,192-216,220–234
ZmPLATZ6	Zm00001d051376	198		64–134			168–181
ZmPLATZ7	Zm00001d051511	251		89–160			15–28,63-78,170-182,197–230
ZmPLATZ8	Zm00001d015394	214		13–84	59–97		102–110,173–185
ZmPLATZ9	Zm00001d015560	237		62–134	19–62
ZmPLATZ10	Zm00001d015868	220		80–152	27–79		173–188
ZmPLATZ11	Zm00001d017682	251		88–159			8–27,169-183,194–230
ZmPLATZ12 (Fl3)	Zm00001d009292	214	1–24	65–144	25–64
ZmPLATZ13	Zm00001d047025	261		112–192			21–36,82-92,232–242
ZmPLATZ14	Zm00001d047250	299		143–217	99–142		5–10,19-43,57-70,73-88,244-256,268–277
ZmPLATZ15	Zm00001d026047	253		88–159			15–26,170-189,195–213
ZmPLATZ16	Zm00001d046688	259		92–163	46–91		183–195
ZmPLATZ17	Zm00001d046958	250		59–129			188–203

ISSN: 1471-2229